Passiert das auch, wenn du solch einen URI unter Start->Ausführen eingibst? Wenn ja, hat es schon mal nichts mit Mozilla zu tun. Wenn du mit Mozilla die Mozilla-Suite meinst, solltest du übrigens umgehend auf den Nachfolger SeaMonkey umsteigen, die Suite wird schon seit Jahren nicht mehr gepflegt und dementsprechend viele Schwachstellen sind darin bekannt. Den Namen Mozilla für Mozilla Firefox zu verwenden ist dagegen ziemlich irreführend. Wenn du den Namen abkürzen willst schreibe Firefox oder Fx, dann ist klar, welcher Browser gemeint ist.
Hast du geprüft, ob Thunderbird sich selbst für den Standard-Mailclient hält? Je nach Windows-Version solltest du auch mal unter Programmzugriff und (Computer-)Standards nachsehen.