also soviel ich weiß ist bei Linux die "Windows"-Taste die "Super" Taste , was du also machen könntest in den bestimmten Anwendungen das "Strg+Alt" durch ein "Super" zu ersetzten.

Ob man es aber regulär so umstellen kann das die Windowstaste ein "Strg+Alt" emuliert wird aber nicht so einfach sein( durch einiges umprogammieren bestimmt möglich) .