Wandele die Animation nach GIF, das ist imo das einzige animiert Format, was der IE von Haus aus beherrscht. Ansonsten bleiben Flash, SVG, MNG oder sowas in der Richtung. Dafür brauchen aber die Besucher dann aber jeweils ein Plugin. Flash ist wohl deutlich verbreiteter als SVG und MNG.
Wenn es eine öffentlich zugängliche Seite sein soll, solltest du auch darauf achten, dass sie in aktuellen Browsern ebenfalls funktioniert.