Zumindest die Sent-Box-Datei kann man einfach rüberkopieren, dann die Mails in die normale Sent-Box verschieben und mit der Erweiterung Remove Duplicate Messages die ggf. enstandenen Doubletten entfernen. Für das Adressbuch ist mir etwas gleich einfaches nicht bekannt, da wäre eventuell der Umweg über ein externes Programm sinnvoll, das die CSV-Listen von beiden Installationen zusammenfügt und dann die Duplikate rauswirft.
Für dauerhafte Synchronisation ist natürlich IMAP und LDAP angesagt, beides beherrscht Thunderbird, daher weiß ich nicht, was du an den Synchronisationsmöglichkeiten auszusetzen hast. Welcher Mailclient bietet da mehr, abgesehen von Groupwarelösungen mit eigenen Servern.